步进电动机与伺服电动机因构造的不同以及使用场合的不同，对应选型的功率规格也不同。当有高输出功率的必要时，如功率超过100W时，通常选择伺服电动机。 
转速转矩特性和定位时间不同。定位距离短，步进电动机根据收到的脉冲信号同步旋转，低转速领域内转矩大(起动/减速时响应性优越)，伺服电动机动作会较脉冲信号延迟(受积存脉冲的影响)，低转速领域内比步进电动机的转矩小。定位距离长，步进电动机在高速领域内比伺服电动转矩小，伺服电动机在高转速领域内比步进电动机转矩大(高速性能优越)。 
在停止精度的差异大。因为步进电动机的静止角度误差受小齿的加工精度的影响，在小齿齿距为7.2°周期时有误差减少的倾向(因励磁相完全相同，所以不受定子小齿的误差影响)。所以，以7.2°为单位进行定位时，静止角度误差也变小。伺服电动机停止位置精度，受编码器的分辨率和编码器与电动机组装精度的影响。所以，若只将编码器调整为高分辨率的话，定位精度不会提升。 
同步性方面。步进电动机因为是开环控制，与输入的脉冲进行同步运行。只要脉冲指令同步输入，就可以进行多台电动机几乎相同的运行。伺服电动机因为是闭环控制，相对脉冲指令发生迟延。控制多台电动机时，因迟延时间各不相同，有互相干扰运行不稳定情况的发生。
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